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2'-TBDMS-rC(Ac) 亚磷酰胺对RNA稳定性和功能的影响

RNA分子在转录、剪接、翻译和转录后基因调控等多种生物学过程中起着至关重要的作用。RNA分子的稳定性和功能取决于其化学组成和结构特征。已将修饰的核苷酸引入RNA以改善其稳定性和功能。在这些修饰的核苷酸中,2'-TBDMS-rC(Ac) 亚磷酰胺已广泛用于修饰RNA分子。然而,这种修饰对RNA稳定性和功能的影响尚未完全阐明。


1.对RNA稳定性的影响


RNA稳定性是决定RNA分子生物活性的重要因素。据报道,2'-TBDMS-rC (Ac) 亚磷酰胺修饰通过增加其对核酸酶水解的抗性来增强RNA分子的稳定性。已经表明,这种修饰提高了RNA分子对核糖核酸酶 (如RNA酶A和RNA酶T1) 和化学核酸酶 (如哌啶) 的抗性。这种修饰增强RNA稳定性的机制之一是保护RNA的2'-OH基团免受亲核攻击。这种修饰还防止了RNA分子中二级结构的形成,这可以促进RNA的稳定性。


2.对RNA功能的影响


RNA功能由其结构特征决定,包括二级和三级结构,结合亲和力和酶活性。已经显示2'-tbdms-rc (Ac) 亚磷酰胺修饰对RNA功能具有最小的影响。这种修饰与各种RNA酶相容,并已用于修饰核酶、RNA适体和sirna而不损害其功能。例如,该修饰已用于改善锤头核酶的活性和稳定性,锤头核酶是切割其他RNA的催化性RNA分子。这种修饰也已用于改善RNA适体的结合亲和力和特异性,RNA适体是可以以高亲和力和特异性结合特定靶标的RNA分子。


总之,2'-TBDMS-rC (Ac) 亚磷酰胺修饰通过增加RNA分子对核酸酶水解的抗性并防止二级结构的形成来增强RNA分子的稳定性。这种修饰对RNA功能的影响最小,并已用于改善RNA酶和适体的活性和稳定性。因此,这种修饰是用于RNA修饰和研究的有用工具。


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