WUHU HUAREN SCIENCE AND TECHNOLOGY CO., LTD.

2'-OMe-rG (ibu) 亚磷酰胺的合成及纯化方法

RNA修饰已成为基因表达调控的重要方面,并已显示在RNA功能,稳定性和翻译调控中起关键作用。核糖核苷的修饰是获得具有用于不同应用的定制性质的不同RNA序列的机会。2'-O-甲基 (2'-OMe) 是用于增强RNA稳定性和与互补RNA序列的结合亲和力的最常掺入的RNA修饰之一。


2'-OMe-rG(ibu) 亚磷酰胺的合成


使用H-膦酸酯化学策略合成2'-OMe-rG (ibu) 亚磷酰胺。该合成包括用合适的活化基团依次活化3'-羟基,然后通过5'-羟基与受保护的核苷偶联。然后将修饰的核糖核苷脱保护,并使用2'-O-甲基-核糖核苷作为起始材料安装2'-OMe基团。

1.3'-羟基的保护: 2'-OMe-rG (ibu) 的合成亚磷酰胺从使用合适的保护基保护核糖核苷的3'-羟基开始。常用的保护基是二甲氧基三苯甲基 (DMT) 或苯甲酰基 (Bz)。

2.3'-羟基的活化: 使用合适的活化剂活化3'-羟基以产生相应的亚磷酰胺中间体。通常,使用2-氰基乙基-N,N,N',N'-四异丙基亚磷酰二酰胺 (iPr2NEt-CN) 或2-氯-2-氧代-1,3,2-氧代膦 (1) 作为活化剂。

3.与受保护的核苷偶联: 使活化的亚磷酰胺中间体与受保护的核苷在温和条件下反应以产生磷酸二酯键。用于合成2'-OMe-rG (ibu) 亚磷酰胺的常见受保护的核苷是N2-isobutyryl-2-O-methylguanosine-3-O-(2-氰基乙基-N,N-二异丙基氨基) 亚磷酰胺。

4.脱保护: 使用合适的脱保护条件除去核苷上的保护基团以获得2'-OMe-rG (ibu) 核苷。

5.2'-OMe基团的安装: 如前所述,使用2'-O-甲基-核糖核苷作为起始材料安装2'-OMe基团。获得的终产物是2'-OMe-rG(ibu) 亚磷酰胺,其可用于RNA合成。


2'-OMe-rG (ibu) 亚磷酰胺的纯化


用于RNA合成的亚磷酰胺的纯度对于生产高质量RNA寡核苷酸至关重要。2'-OMe-rG (ibu) 亚磷酰胺的纯化涉及一系列色谱纯化技术以去除杂质并获得高纯度产物。

1.反相色谱: 将合成后获得的粗产物进行反相色谱,使用C18或C8柱,用合适的洗脱系统除去杂质。

2.离子交换色谱: 使用离子交换色谱进一步纯化反相纯化的产物以除去任何残留的杂质。

3.尺寸排阻色谱: 最后,对产物进行尺寸排阻色谱以除去任何残留试剂或副产物并获得纯的2'-OMe-rG (ibu) 亚磷酰胺。


总之,2'-OMe-rG(ibu) 亚磷酰胺的合成和纯化涉及一系列旨在获得用于RNA合成的高质量产物的步骤。H-膦酸酯化学方法是合成亚磷酰胺的常用方法,纯化涉及一系列色谱技术。所得产物可用于合成具有针对不同RNA应用的定制性质的RNA寡核苷酸。


新闻
Recommended Haren Chemical Reagents News